The 2016 PROTEO/CERMM Summer School on Computational Drug Design will be held on August 18th and 19th in Montreal at Concordia University (Downtown Campus). It will provide an introduction to computational techniques in biochemistry and computational drug design using the software MOE. MOE is a leading software in the pharmaceutical industry for drug discovery. The summer school is designed especially for non-specialists and non-programmers.

 

In the mornings, you will receive an accessible theoretical introduction to the application of each subject including examples from literature, followed by a workshop in the afternoons where you will reproduce computational experiments. The experiments will be taught using protocols, which can later be used with your system in your laboratory. The software can be installed on your own computer and is available for Windows, Mac and Linux. A tutorial for the installation of the software will be sent by email in the next weeks.

 

Dr. Sanjay Srivastava (Paraza Pharma Inc) will give us insights into the importance of computational tools in industrial research. In addition, he will provide an introduction to computational drug design, including combinatorial libraries of ligands and pharmacophores (for short bio refere to program on your right). Guillaume Lamoureux (Concordia University) will give an introduction to force fields and how to evaluate interactions between proteins and ligands. An introduction to computational protein design will be given by Joelle Pelletier (University of Montreal). Finally, the theoretical background of molecular docking and homology modelling will be covered by Maximilian Ebert (University of Montreal). The workshops will be hosted by Audrey Bonin from the developers of MOE (CCG).

 

If you have any questions please do not hesitate to contact Maximilian Ebert (m.ebert@umontreal.ca). For PROTEO members: Accommodation for one night will be covered and organized through the PROTEO network. Transportation will also be covered, however needs to be organized by the individuals (reimbursement please contact Pierre-Yves Savard (Pierre-Yves.Savard@proteo.ulaval.ca).

 

The number of seats is limited to 50, so register as soon as possible!

 

For more information, please visit:

 

http://www.esi.umontreal.ca/~pelletjo/proteo2016/

 

                                                                   PROGRAM

Day 1 : August 18th

Subject

Schedule

Registration and breakfast

 

10h00 - 10h25

Introduction to the workshop

 

10h25 - 10h30

LECTURE: Computational Chemistry involvement in Pharmaceutical Drug Discovery programs: Co-existence of the Good, Bad and Ugly

Dr. Sanjay Srivastava 

10h30 - 12h00

LECTURE: Force field and proteins/ligands interactions

Guillaume Lamoureux

12h00 - 13h30

Lunch

 

13h30 - 14h30

TUTORIAL: Computational drug design 1

Audrey Bonin

14h30 - 16h00

Coffee break

 

16h00 - 16h20

TUTORIAL: Computational drug design 2

Audrey Bonin

16h20 - 17h50

Reception

 

17h50 - 20h00

 

 

Day 2 : August 19th

Subject

Schedule

Breakfast

 

9h00 - 9h30

LECTURE: Protein and antibody modelling

Joelle Pelletier

9h30 - 11h00

LECTURE: Homology modelling and molecular docking

Maximilian Ebert

11h00 - 12h00

Lunch

 

12h00 - 13h00

TUTORIAL: Protein and antibody modelling 1

Audrey Bonin

13h00 - 14h30

Coffee break

 

14h30 - 14h50

TUTORIAL: Protein and antibody modelling 2

Audrey Bonin

14h50 - 16h20

Q&A How I can apply this to my research?

 

16h20 - 17h00

Closing remarks

 

17h00 - 17h15

 

 

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L’école d’été PROTEO/CERMM sur la conception de médicaments assistée par ordinateur (Computational Drug Design) aura lieu du 18 au 19 août 2016 à l’Université Concordia à Montréal (Campus Centre-Ville). Cette école fournira une introduction sur les techniques informatiques utilisées en biochimie pour la conception de médicaments à l’aide du logiciel MOE. MOE est le logiciel le plus utilisé en industrie pharmaceutique pour la découverte de médicaments. Cette école d’été s’adresse principalement aux non-spécialistes et non-programmeurs.

 

Pour chaque sujet, vous aurez une introduction, en matinée, sur la théorie et son application comprenant aussi des exemples tirés de la littérature suivie d’ateliers, en après-midi, où vous allez reproduire des expériences informatiques. Ces expériences seront enseignées à l’aide de protocoles qui pourront, par la suite, être utilisés dans votre laboratoire pour votre système. Le logiciel MOE peut être installé sur votre propre ordinateur et est disponible sur Windows, Mac et Linux. Un tutoriel pour l’installation du logiciel sera envoyé par courriel dans les prochaines semaines.

 

Dr. Sanjay Srivastava (Paraza Pharma Inc) va nous donner une vue d’ensemble sur l’importance des outils informatiques en recherche industrielle. En plus, il va donner une introduction à la conception de médicaments assistée par ordinateur incluant les librairies combinatoires et les pharmacophores (pour une courte presentation allez consulter le programm a votre droite). Guillaume Lamoureux (Université Concordia) va donner une introduction sur les champs de force et les interactions entre les protéines et ligands. Par la suite, Joelle Pelletier (Université de Montréal) donnera une introduction sur l’ingénierie de protéines. Finalement, les sujets d’amarrage moléculaire et de modèles par homologie seront couverts par Maximilian Ebert (Université de Montréal). Les ateliers vont être dirigés par Audrey Bonin provenant de CCG, les développeurs du logiciel MOE.

 

Si vous avez des questions, n’hésitez pas à contacter Maximilian Ebert (m.ebert@umontreal.ca). Pour les membres de PROTEO, l’hébergement d’une nuit sera payé et organisé par le réseau PROTEO. Le transport sera aussi payé par le réseau PROTEO, mais celui-ci devra être organisé par chacun (Pour le remboursement, veuillez contacter Pierre-Yves Savard (Pierre-Yves.Savard@proteo.ulaval.ca).

 

Faites vite! Les places sont limitées à 50 personnes.

 

Pour plus d'informations:

 

http://www.esi.umontreal.ca/~pelletjo/proteo2016/

 

August 18-19 2016


MB Building (John Molson) - Room MB-5.265
1450 Rue Guy
Montréal, Québec
Canada, H3H 1J5


Registrations


June 16 2016 (00:00 EDT) to August 6 2016 (00:00 EDT)

Contact organizers


m.ebert@umontreal.ca

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2016 PROTEO summer school program.pdf
2016 PROTEO Summer School flyer.pdf

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